MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia fergusonii ATCC 35469 plasmid pEFER

Total Repeats: 850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011743	AGTTC	2	10	465	474	20 %	40 %	20 %	20 %	218561637
2	NC_011743	TGGG	2	8	561	568	0 %	25 %	75 %	0 %	218561637
3	NC_011743	CTA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561637
4	NC_011743	A	6	6	633	638	100 %	0 %	0 %	0 %	218561637
5	NC_011743	AAG	2	6	898	903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561637
6	NC_011743	GAA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561637
7	NC_011743	TGGC	2	8	930	937	0 %	25 %	50 %	25 %	218561637
8	NC_011743	TC	3	6	1038	1043	0 %	50 %	0 %	50 %	218561637
9	NC_011743	CAC	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218561637
10	NC_011743	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561637
11	NC_011743	GAA	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561637
12	NC_011743	A	6	6	1305	1310	100 %	0 %	0 %	0 %	218561637
13	NC_011743	GCC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218561638
14	NC_011743	GCC	2	6	1754	1759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218561638
15	NC_011743	CTT	2	6	1871	1876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561639
16	NC_011743	TCGC	2	8	1932	1939	0 %	25 %	25 %	50 %	218561639
17	NC_011743	GCG	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561639
18	NC_011743	TGTA	2	8	2584	2591	25 %	50 %	25 %	0 %	218561640
19	NC_011743	GGT	3	9	2600	2608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561640
20	NC_011743	GCT	2	6	2768	2773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561640
21	NC_011743	GAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561640
22	NC_011743	TAT	2	6	2833	2838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561640
23	NC_011743	TG	3	6	2904	2909	0 %	50 %	50 %	0 %	218561640
24	NC_011743	GGC	2	6	3043	3048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561640
25	NC_011743	TTC	2	6	3094	3099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561640
26	NC_011743	ATGG	2	8	3146	3153	25 %	25 %	50 %	0 %	218561640
27	NC_011743	ATG	2	6	3348	3353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561640
28	NC_011743	CAG	2	6	3384	3389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561640
29	NC_011743	GAAAA	2	10	3465	3474	80 %	0 %	20 %	0 %	218561641
30	NC_011743	CAG	2	6	3703	3708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561641
31	NC_011743	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561641
32	NC_011743	TGA	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561641
33	NC_011743	GGC	3	9	3999	4007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561641
34	NC_011743	CTT	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561641
35	NC_011743	GAA	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561641
36	NC_011743	TCAGC	2	10	4141	4150	20 %	20 %	20 %	40 %	218561641
37	NC_011743	GCGA	2	8	4172	4179	25 %	0 %	50 %	25 %	218561641
38	NC_011743	AGA	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561641
39	NC_011743	GAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561641
40	NC_011743	CG	3	6	4308	4313	0 %	0 %	50 %	50 %	218561641
41	NC_011743	AAT	2	6	4424	4429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561641
42	NC_011743	CCCCG	2	10	4601	4610	0 %	0 %	20 %	80 %	218561642
43	NC_011743	GTT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561642
44	NC_011743	TCA	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561642
45	NC_011743	GGCG	2	8	4685	4692	0 %	0 %	75 %	25 %	218561642
46	NC_011743	TCG	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561642
47	NC_011743	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561642
48	NC_011743	AAG	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561642
49	NC_011743	GTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561642
50	NC_011743	TGA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561642
51	NC_011743	TCG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561642
52	NC_011743	GAC	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561642
53	NC_011743	ACCC	2	8	5218	5225	25 %	0 %	0 %	75 %	218561642
54	NC_011743	C	6	6	5223	5228	0 %	0 %	0 %	100 %	218561642
55	NC_011743	TTC	2	6	5233	5238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561642
56	NC_011743	CTG	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561642
57	NC_011743	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561642
58	NC_011743	TCC	2	6	5516	5521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561642
59	NC_011743	TCA	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561642
60	NC_011743	CG	3	6	5535	5540	0 %	0 %	50 %	50 %	218561642
61	NC_011743	AT	3	6	5581	5586	50 %	50 %	0 %	0 %	218561642
62	NC_011743	T	6	6	5586	5591	0 %	100 %	0 %	0 %	218561642
63	NC_011743	T	6	6	5606	5611	0 %	100 %	0 %	0 %	218561642
64	NC_011743	GCGA	2	8	5662	5669	25 %	0 %	50 %	25 %	218561642
65	NC_011743	CGT	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561642
66	NC_011743	GAC	2	6	5695	5700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561642
67	NC_011743	CTTTC	2	10	5707	5716	0 %	60 %	0 %	40 %	218561642
68	NC_011743	GAT	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561643
69	NC_011743	GAC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561643
70	NC_011743	TCG	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561643
71	NC_011743	AGG	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561643
72	NC_011743	CAG	2	6	5904	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561643
73	NC_011743	CAG	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561643
74	NC_011743	GTA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561643
75	NC_011743	CAG	3	9	6113	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561643
76	NC_011743	ATGG	2	8	6158	6165	25 %	25 %	50 %	0 %	218561643
77	NC_011743	TCC	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561643
78	NC_011743	TACA	2	8	6245	6252	50 %	25 %	0 %	25 %	218561643
79	NC_011743	GCCA	2	8	6389	6396	25 %	0 %	25 %	50 %	218561643
80	NC_011743	CAT	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561643
81	NC_011743	CGG	2	6	6496	6501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561644
82	NC_011743	GGA	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561645
83	NC_011743	GGA	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561645
84	NC_011743	GCT	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561645
85	NC_011743	ACGAT	2	10	6745	6754	40 %	20 %	20 %	20 %	218561645
86	NC_011743	CCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218561645
87	NC_011743	CCA	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218561645
88	NC_011743	AC	3	6	7133	7138	50 %	0 %	0 %	50 %	218561645
89	NC_011743	GAT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561645
90	NC_011743	CAAA	2	8	7206	7213	75 %	0 %	0 %	25 %	218561645
91	NC_011743	GGGTTC	2	12	7236	7247	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218561645
92	NC_011743	TCCATC	2	12	7467	7478	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218561648
93	NC_011743	CCT	2	6	7486	7491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561648
94	NC_011743	GTG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561648
95	NC_011743	CCGC	2	8	7666	7673	0 %	0 %	25 %	75 %	218561648
96	NC_011743	A	6	6	7712	7717	100 %	0 %	0 %	0 %	218561648
97	NC_011743	GGT	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561649
98	NC_011743	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561649
99	NC_011743	TGGC	2	8	7957	7964	0 %	25 %	50 %	25 %	218561649
100	NC_011743	GCA	2	6	8053	8058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561649
101	NC_011743	GC	3	6	9033	9038	0 %	0 %	50 %	50 %	218561650
102	NC_011743	ATGT	2	8	9104	9111	25 %	50 %	25 %	0 %	218561650
103	NC_011743	GCC	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218561650
104	NC_011743	CG	3	6	9243	9248	0 %	0 %	50 %	50 %	218561650
105	NC_011743	GATCA	2	10	9626	9635	40 %	20 %	20 %	20 %	218561651
106	NC_011743	GCAAA	2	10	9668	9677	60 %	0 %	20 %	20 %	218561651
107	NC_011743	TCA	2	6	9717	9722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561651
108	NC_011743	CTGG	2	8	9742	9749	0 %	25 %	50 %	25 %	218561651
109	NC_011743	ATG	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561651
110	NC_011743	CTT	2	6	9789	9794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561651
111	NC_011743	GC	3	6	9874	9879	0 %	0 %	50 %	50 %	218561651
112	NC_011743	T	6	6	9903	9908	0 %	100 %	0 %	0 %	218561651
113	NC_011743	TGA	2	6	9912	9917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561651
114	NC_011743	CAG	2	6	9952	9957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561651
115	NC_011743	CGC	2	6	10088	10093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218561651
116	NC_011743	AC	3	6	10131	10136	50 %	0 %	0 %	50 %	218561651
117	NC_011743	ATC	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561651
118	NC_011743	GCA	2	6	10229	10234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561651
119	NC_011743	GCG	2	6	10279	10284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561651
120	NC_011743	GC	3	6	10296	10301	0 %	0 %	50 %	50 %	218561651
121	NC_011743	ACA	2	6	10409	10414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561651
122	NC_011743	GCGT	2	8	10572	10579	0 %	25 %	50 %	25 %	218561651
123	NC_011743	GCT	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561652
124	NC_011743	CACC	2	8	10872	10879	25 %	0 %	0 %	75 %	218561652
125	NC_011743	CGA	2	6	11407	11412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561653
126	NC_011743	ATC	2	6	11417	11422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561653
127	NC_011743	CGAAGC	2	12	11433	11444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561653
128	NC_011743	GAC	2	6	11490	11495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561653
129	NC_011743	GCT	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561653
130	NC_011743	CGG	2	6	11538	11543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561653
131	NC_011743	GAT	2	6	11624	11629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561653
132	NC_011743	GGC	2	6	11940	11945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561653
133	NC_011743	GTC	2	6	11961	11966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561653
134	NC_011743	GCA	2	6	12005	12010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561653
135	NC_011743	AAAC	2	8	12038	12045	75 %	0 %	0 %	25 %	218561653
136	NC_011743	GCT	2	6	12116	12121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561654
137	NC_011743	GAT	2	6	12135	12140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561654
138	NC_011743	AGC	2	6	12153	12158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561654
139	NC_011743	TCG	2	6	12166	12171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561654
140	NC_011743	TGT	3	9	12178	12186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561654
141	NC_011743	GGA	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561654
142	NC_011743	TG	3	6	12260	12265	0 %	50 %	50 %	0 %	218561654
143	NC_011743	TACA	2	8	12316	12323	50 %	25 %	0 %	25 %	218561655
144	NC_011743	TC	3	6	12453	12458	0 %	50 %	0 %	50 %	218561655
145	NC_011743	CTACC	2	10	12471	12480	20 %	20 %	0 %	60 %	218561655
146	NC_011743	CAT	2	6	12552	12557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561655
147	NC_011743	TGC	2	6	12656	12661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561655
148	NC_011743	GA	3	6	12701	12706	50 %	0 %	50 %	0 %	218561655
149	NC_011743	AGAAA	2	10	12753	12762	80 %	0 %	20 %	0 %	218561655
150	NC_011743	CAA	2	6	12795	12800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561655
151	NC_011743	GAC	2	6	12801	12806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561655
152	NC_011743	TTG	2	6	12807	12812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561655
153	NC_011743	GAT	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561656
154	NC_011743	ACA	2	6	12928	12933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561656
155	NC_011743	AG	3	6	12961	12966	50 %	0 %	50 %	0 %	218561656
156	NC_011743	TAGCG	2	10	13040	13049	20 %	20 %	40 %	20 %	218561656
157	NC_011743	AAC	2	6	13098	13103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561656
158	NC_011743	TATG	2	8	13106	13113	25 %	50 %	25 %	0 %	218561656
159	NC_011743	GTT	2	6	13157	13162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561656
160	NC_011743	CGA	2	6	13189	13194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561656
161	NC_011743	GCG	2	6	13293	13298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561656
162	NC_011743	CATA	2	8	13310	13317	50 %	25 %	0 %	25 %	218561656
163	NC_011743	CG	3	6	13320	13325	0 %	0 %	50 %	50 %	218561656
164	NC_011743	TTGA	2	8	13392	13399	25 %	50 %	25 %	0 %	218561656
165	NC_011743	AGTTG	2	10	13481	13490	20 %	40 %	40 %	0 %	218561656
166	NC_011743	ACG	2	6	13507	13512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561656
167	NC_011743	TGC	2	6	13775	13780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561656
168	NC_011743	AAT	2	6	13880	13885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561657
169	NC_011743	A	6	6	13902	13907	100 %	0 %	0 %	0 %	218561657
170	NC_011743	AGA	2	6	13913	13918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561657
171	NC_011743	TTC	2	6	13951	13956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561657
172	NC_011743	A	6	6	13959	13964	100 %	0 %	0 %	0 %	218561657
173	NC_011743	TGA	2	6	14024	14029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561657
174	NC_011743	TGA	2	6	14080	14085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561657
175	NC_011743	TCAT	2	8	14095	14102	25 %	50 %	0 %	25 %	218561657
176	NC_011743	TCG	2	6	14147	14152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561657
177	NC_011743	A	7	7	14253	14259	100 %	0 %	0 %	0 %	218561657
178	NC_011743	AAC	2	6	14265	14270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561657
179	NC_011743	TTGA	2	8	14388	14395	25 %	50 %	25 %	0 %	218561657
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181	NC_011743	GATA	2	8	14629	14636	50 %	25 %	25 %	0 %	218561658
182	NC_011743	GAG	2	6	14642	14647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561658
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185	NC_011743	T	6	6	15033	15038	0 %	100 %	0 %	0 %	218561659
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189	NC_011743	TGA	2	6	15115	15120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561659
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192	NC_011743	CTT	2	6	15238	15243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561659
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215	NC_011743	TTTG	2	8	17143	17150	0 %	75 %	25 %	0 %	218561659
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223	NC_011743	A	6	6	17570	17575	100 %	0 %	0 %	0 %	218561659
224	NC_011743	GCGT	2	8	17595	17602	0 %	25 %	50 %	25 %	218561659
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232	NC_011743	CGT	2	6	18431	18436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561659
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242	NC_011743	GCA	2	6	18923	18928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561660
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247	NC_011743	CGA	2	6	19178	19183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561660
248	NC_011743	GGAAGA	2	12	19238	19249	50 %	0 %	50 %	0 %	218561660
249	NC_011743	TGA	2	6	19274	19279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561660
250	NC_011743	GCTC	2	8	19311	19318	0 %	25 %	25 %	50 %	218561660
251	NC_011743	CCAT	2	8	19342	19349	25 %	25 %	0 %	50 %	218561660
252	NC_011743	GAA	2	6	19374	19379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561660
253	NC_011743	GCG	2	6	19429	19434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218561660
254	NC_011743	ACT	2	6	19437	19442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561660
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256	NC_011743	GAA	2	6	19506	19511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561660
257	NC_011743	GATGA	2	10	19527	19536	40 %	20 %	40 %	0 %	218561660
258	NC_011743	CT	3	6	19596	19601	0 %	50 %	0 %	50 %	218561660
259	NC_011743	CAA	2	6	19750	19755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561660
260	NC_011743	TCC	2	6	19762	19767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561660
261	NC_011743	CAC	2	6	19785	19790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218561660
262	NC_011743	GTT	2	6	19871	19876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561660
263	NC_011743	TTG	2	6	20079	20084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561660
264	NC_011743	TGT	2	6	20089	20094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561660
265	NC_011743	GTTT	2	8	20149	20156	0 %	75 %	25 %	0 %	218561660
266	NC_011743	TAA	2	6	20222	20227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561660
267	NC_011743	CAA	2	6	20261	20266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561660
268	NC_011743	A	6	6	20278	20283	100 %	0 %	0 %	0 %	218561660
269	NC_011743	GCA	2	6	20303	20308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561660
270	NC_011743	CAT	2	6	20359	20364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561660
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274	NC_011743	A	6	6	20508	20513	100 %	0 %	0 %	0 %	218561661
275	NC_011743	GC	3	6	20526	20531	0 %	0 %	50 %	50 %	218561661
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278	NC_011743	TAGA	2	8	20893	20900	50 %	25 %	25 %	0 %	218561661
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284	NC_011743	AAAG	2	8	21158	21165	75 %	0 %	25 %	0 %	218561661
285	NC_011743	GGT	2	6	21182	21187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561661
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296	NC_011743	CTG	2	6	21798	21803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561661
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302	NC_011743	TA	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	218561661
303	NC_011743	AAC	2	6	22201	22206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561661
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383	NC_011743	GTT	2	6	26557	26562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561662
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387	NC_011743	A	7	7	26851	26857	100 %	0 %	0 %	0 %	218561663
388	NC_011743	AAG	2	6	26944	26949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561663
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499	NC_011743	GACGC	2	10	32620	32629	20 %	0 %	40 %	40 %	218561666
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